外部数据传输测试

流程图

外部数据传输测试

DM-OP-018 外部数据管理 External Data Management V1

流程

说明

 

EDM系统,more

 

sFTP系统,more

 

 

 

流程说明

DTAData Transfer Agreement 数据传输协议)定稿后,正式数据传输前,外部数据供应商需按照DTA的规定,进行至少一次成功的数据传输测试。数据传输方式介绍如下:

 

  1. EDMSExternal Data Management 外部数据管理)(首选)

 

  • 在外部数据管理-数据供应商中填写完数据供应商相关人员信息后,系统可自动生成培训记录模板。若该人员此前未参与EDM系统培训,系统生成的培训记录为docx文件EDM 补充相关信息后,点击发送电子签,同时EDM手册会作为附件同步发送,数据供应商相关人员完成手册自学后签署电子签,系统生成签字版培训记录存档;若该人员此前已参与并完成EDM系统培训,系统自动抓取该人员签字版培训记录,无需重新签字。
  • EDM点击“账户管理表_申请”,为该人员开通项目EDM 系统账户
  • 系统角色与权限表如下:

 

权限

角色

查看数据

上传数据

下载数据

外部数据上传员(EDA

外部数据管理负责人 MEDM

外部数据管理员

EDM

数据分析人员

Analyst

 

  1. sFTPsecure File Transfer Protocol 安全文件传输协议)(次选)

 

EDM点击“账户管理表_申请”,为该人员开通项目sFTP系统账户,在线发送邮件给恒瑞系统支持(hrtau.support@hengrui.com)

EDMvendor(外部数据供应商)文件夹:

三级

四级

五级

EDM

统计编程

Blind

统计编程

Unblind

医学

Blind

医学

Unblind

药理

Blind

药理

Unblind

 

 

EDM

 

PKPD

Blind(盲态)

上传

下载

下载

下载

下载

下载

下载

Unblind(非盲)

上传

下载

下载

下载

……

……

 

 

 

 

 

 

 

 

三级

四级

EDM

Vendor A

Vendor B

 

 

Vendor

 

Vendor A

下载

上传

Vendor B

下载

上传

……

下载

  • WI爱数路径:AnyShare://临床文件管理部/临床相关部门-质量文件(附目录)/05-临床数据科学中心 (CDSC)/ DM-WI-002 电子数据传输指南Electronic Data Transfer Guideline_V1

 

  1. 传输过程

DTA 签字定稿后,EDM点击数据传输协议-测试数据申请,邮件通知外部数据供应商进行传输测试;

外部数据供应商严格按照DTA要求使用测试数据进行传输。注:测试数据一般使用非真实数据。

 

注:

1-测试数据需使用Dummy data(非真实数据), 受试者代码和数据格式必须与DTA保持一致

2-关于VISIT以及PCTPT列,建议参考wordDTA,因为PDF版可能有些格式上的小问题(例如空格问题)

3-测试数据条数请大于50条(后期编程程序搭建需求)

4-请通过EDM系统进行数据传输,数据文件要求:不加密,CSV格式,不允许使用压缩包。

检测方上传测试数据后EDM 通过CDTMS 外部数据管理-数据(测试)检查对传输的过程和内容进行线上核查:新增一条记录, 选择外部数据类型、供应商及测试数据文件,填写外部数据集说明(DTA中数据集说明描述)。格式检查选择“做”,点击保存。点击“Format Check/Recon”,系统自动进行测试数据格式检查,生成格式检查结果。格式检查发现问题,可通过线上邮件将格式检查结果反馈给供应商进行修正,并重新进行传输测试,直至传输核查通过为止。

EDM根据项目组要求,将审核通过的测试数据文件通过EDM/sFTP系统传输给项目组相关人员。

4.格式检查内容

外部数据格式检查

格式检查类型

测试数据

检查方式

  1. SAS程序检查(如适用)
  2. 手动检查

 

 

 

数据集常规检查

  1. 文件命名是否符合DTA要求
  2. 文件格式是否符合DTA要求
  3. 文件传输方式是否符合DTA要求
  4. 文件类型是否符合DTA要求(例如累积型)
  1. 外部数据列名称、顺序与DTA规定变量名一致
  2. 外部数据集每列变量是否与DTA数据集中规定的逻辑一致
  3. 外部数据字符长度、格式和必填项是否与DTA一致
  4. 外部数据集变量访视名称时间点是否与DTA访视附表规定一致

PKPD

 

  1. 外部数据结果值是否超出定量上下限;
  2. 外部数据文件中的变量名后缀为“_REFID”的变量值不重复;
  3. 外部数据文件中所有“_ORRES”值均为空时,后缀“_COM”的变量不为空

ADA/NAB

  1. ADA筛选结果为阴性,ADA确证结果无;
  2. ADA筛选结果为阳性,ADA确证结果列须有值;
  3. ADA筛选结果为阳性,ADA确证结果为阳性,Titer (ADA)NAb result必有值.

Lab/Biomarker

  1. 外部数据文件中的变量名后缀为“_REFID”的变量值不重复
  2. 外部数据文件中所有“_ORRES”值均为空时,变量名后缀“_STAT”需填写为“not done”。
  3. 外部数据文件中所有“_ORRES”值均为空时,后缀“_COM”的变量不为空。

ECG/Holter

外部数据与DTA附录中参考值以及逻辑关系是否一致

  1. 检查项名称、类别和单位等信息是否与附录信息一致
  2. 检查项名称、类别和单位等信息逻辑关系是否与附录一致
  3. 结果等相关信息是否与附录信息一致
  4. 结果等相关信息逻辑关系是否与附录一致

IRC/IPRC

  1. 外部数据相关变量是否与DTA给出的“Possible Values”完全一致或者逻辑/形式一致
  2. 外部数据与DTA附录中参考值以及逻辑关系是否一致
    1. 外部数据检查方法是否与DTA检查方式附表规定一致
    2. 检查项名称、检查项简称等信息是否与附录信息一致
    3. 结果等相关信息是否与附录信息一致
    4. 结果等相关信息逻辑关系是否与附录一致。

备注:EDM不对数据集的深层逻辑进行核查,统计,编程以及医学经理需要同步核查IRC测试数据集是否满足需求。

 

CDTMS填写要求

  • 由本项目外部数据管理员负责填写,外部数据管理员在数据传输协议定稿后进行测试数据传输时填写。若线上程序无法运行,可上传SAS 格式检查结果报告。
  • 人工填写字段:
    “外部数据类型”:根据实际情况选择,需与EDM系统中外部数据类型保持一致。
    “外部数据文件”:对接EDM系统中EDA上传的测试数据,可选择文件名中含有tst,文件状态为“待审核“或“通过”的文件。
    “外部数据集说明”:填写DTA数据集说明内容。例如:PKPD
  • 自动生成字段:
    “第三方供应商”:选择外部数据文件后,自动同步EDM系统中的供应商名称。若EDM系统与数据传输协议中第三方供应商名称不一致,需要重新下拉选择与数据传输协议中第三方供应商名称保持一致,才能保证后续SAS程序正常运行。
  • 具体的操作步骤流程如下:
    格式检查选择“做”,点击“保存”,点击“Format Check/Recon”,系统自动进行测试数据格式检查,完成后会生成格式检查结果及格式检查运行日志。查看格式检查结果,确认检查结果为“通过”或“不通过”,根据需要可点击“格式问题反馈”,将格式检查结果反馈给检测方。
  • 工作流:
    未提交-结果待确认-已锁定

 

 

外部数据设盲测试与审核

流程说明

若项目外部数据有设盲,需在CDTMS-临床研究-数据设盲计划-外部数据设盲选择“是”。外部数据管理-计划阶段可显示“数据设盲设计与审核

1. 新增一条记录,选择“盲态角色、“外部数据类型”及外部数据测试文件;

2.根据数据设盲计划或EDMP 填写外部数据设盲方式,保存后点击外部数据设盲”;

3.生成设盲后外部数据以及设盲前后数据比对报告,发送EDM QC 审核;

4.EDM QC 审核通过后,选择设盲后外部数据审核,发送给相关项目组人员审核;

5.项目组人员审核,并邮件确认设盲后测试数据是否满足项目组需求;

6.待收到项目组邮件确认后, EDM 需上传项目组确认邮件,并激活此条设盲规则,激活后方可在进行阶段针对正式数据进行设盲操作。

 

CDTMS填写要求

  • 填写要求:临床研究-数据设盲计划-外部数据设盲选择“是”,才可进行填写。
  • 人工填写字段:
    “盲态角色”:根据实际情况选择,可同时选择多个角色
    “外部数据类型”:根据实际情况选择
    “外部数据文件”:对接EDM系统中EDA上传的测试数据,可选择文件名中含有tst,文件状态为“待审核“或“通过”的文件。
    “不传输变量”:根据设盲计划或EDMP,填写不进行传输的变量,将所填写的变量值置空。填写规则:单变量无需填写分隔符,多变量,中间用英文逗号隔开;
    “掩码9999变量”:根据设盲计划或EDMP,填写掩码9999的变量,将所填写的变量值掩码为9999。填写规则:单变量无需填写分隔符,多变量,中间用英文逗号隔开;
    “二次编码排序”:指二次编码是否需要排序,不需要排序选“否”,需要排序选“是”,排序规则默认为SUBJID+VISIT
    “二次编码(随机替换)变量”:根据设盲计划或EDMP,填写需要随机替换的变量。应用场景举例:将外部数据中CN01001全部替换为CN01003CN01001CN01003均为外部数据中存在的SUBJID。若项目要求组内随机替换,可在随机替换变量中补充组别字段(外部数据中组别字段默认为“ARM”,其余写法系统无法识别);
    “二次编码(Dummy替换)变量”:根据设盲计划或EDMP,填写需要用Dummy值替换的变量,指非真实值替换真实值。应用场景举例:将外部数据中CN01001全部替换成CN09801CN01001是外部数据中存在的SUBJIDCN09801是外部数据中不存在的SUBJID
    “敏感信息删除”:选择“Yes”则需要填写敏感变量值,选择“No”则无需填写。应用场景举例:1、一个字段下只剔除某个值的记录。如:将外部数据中“计划外访视”的记录剔除,则填写:visit=计划外访视 2、一个字段下剔除多个值的记录,用“+”链接。如:将外部数据中“计划外访视”和“提前退出”访视的记录剔除,则填写:visit=计划外访视+提前退出 3、多个字段下,剔除多个值的记录,不同字段用英文逗号隔开,同一字段下不同值用“+”隔开。将外部数据中“计划外访视”和“提前退出”访视的记录剔除,并外部数据中CN01001受试者的全部记录剔除,则填写:visit=计划外访视+提前退出, subjid=CN01001
    备注:“二次编码(随机替换)/Dummy替换)变量”与“敏感信息删除”同时选择,先进行“二次编码(随机替换)/Dummy替换), 后进行敏感信息删除。
  • 具体的操作步骤流程如下:
    1、选择盲态角色、外部数据类型和需要进行设盲的测试外部数据文件,根据设盲计划或EDMP填写外部数据设盲设置页面,点击保存,系统自动生成设盲控制号;
    2、点击“外部数据设盲”,生成设盲后外部数据以及设盲前后数据比对报告,点击“发送EDM(QC)审核”;
    3EDM(QC)审核通过后,EDM点击“发送盲态角色审核”,将设盲后的测试数据通过在线审核形式发送给相关项目组人员
    4、项目组人员审核确认设盲后的测试数据满足需求后,点击“通过”该条设盲规则自动更新为激活状态,该条设盲记录可在正式数据中使用;若项目组人员审核后,点击“不通过”,则该条设盲记录状态更新为“已退回”, EDM需重新进行设盲操作

工作流:
未提交-EDM(QC)审核-待确认-已激活/已退回

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